Đối với những trường hợp nhà xây không phép, sai phép sẽ nộp phạt bằng tiền khi thỏa mãn tất cả các điều kiện: Công trình xây dựng đã đưa vào sử dụng, đã hoàn thành hoặc hành vi vi phạm hành chính đã kết thúc.
Sẽ không cho nhà xây trái phép nộp phạt để tồn tại.
Tuy nhiên, thời điểm xác định hành vi vi phạm được phép áp dụng quy định này chưa được nêu rõ trong Nghị định. Hiện, Nghị định sửa đổi, bổ sung theo hướng chỉ áp dụng quy định này với các trường hợp thỏa mãn điều kiện nộp phạt trước ngày Nghị định 121có hiệu lực, nghĩa là trước ngày 30-11-2013 đang được Bộ Xây dựng soạn thảo để trình Chính phủ xem xét.
Chủ đầu tư sẽ được điều chỉnh giấy phép xây dựng hoặc làm thủ tục xin cấp giấy phép xây dựng trong trường hợp đối tượng này đã nộp phạt đầy đủ và nộp số lợi bất hợp pháp theo quyết định. Tuy nhiên, nhằm hỗ trợ và tạo điều kiện thuận lợi cho người dân cũng như cơ quan quản lý thì sau khi chủ đầu tư hoàn tất việc nộp tiền trên, các cơ quan có thẩm quyền sẽ xem xét, cho phép công trình nào đủ điều kiện tồn tại và cấp giấy chứng nhận sở hữu theo quy định.
Bộ Xây dựng cũng quy định rõ, đối với trường hợp vi phạm thuộc thẩm quyền xử phạt của nhiều người sẽ do người thụ lý đầu tiên thực hiện. Đồng thời, chỉ định Chánh Thanh tra Sở Xây dựng phối hợp cùng Chủ tịch UBND cấp huyện áp dụng biện pháp khắc phục hậu quả buộc nộp lại số lợi bất hợp pháp đối với các đối tượng vi phạm xây dựng.