Quy mô quy hoạch phân khu đô thị Phú Xuyên vào khoảng 895,5 ha.
Cụ thể, quy mô quy hoạch phân khu đô thị Phú Xuyên vào khoảng 895,5 ha, quy mô dân số đến năm 2030 dự kiến khoảng 28.886 người. Theo quy hoạch, đây là khu vực đô thị cải tạo và đô thị mới, gồm các chức năng ở mới và khu dân cư cải tạo chỉnh trang, thương mại dịch vụ, hỗn hợp,... Là khu trung tâm hành chính, thương mại tổng hợp có vai trò hạt nhân phát triển của đô thị, thu hút các hoạt động thương mại, sản xuất, kinh doanh và hoạt động văn hóa giao lưu của đô thị với vùng phụ cận, gồm các chức năng như trung tâm hành chính, ngân hàng, tài chính, thương mại, văn phòng, trung tâm văn hóa vui chơi tổng hợp.
Đây cũng là trung tâm đào tạo có vai trò cung cấp, nâng cao nguồn nhân lực cho phát triển tại khu vực Phú Xuyên và vùng lân cận với các ngành nghề ưu tiên như hệ thống trung tâm đào tạo, nghiên cứu công nghệ sinh học, trường đầu ngành, trọng điểm quốc gia, công nghệ ứng dụng sản xuất nông nghiệp và chế biến sản phẩm nông nghiệp, phát triển các cơ sở đào tạo dạy nghề cho nhu cầu lao động của vùng. Bao gồm các chức năng chính như viện đầu ngành, trung tâm nghiên cứu, phòng thí nghiệm, nhà ở thương mại, trường đại học và dạy nghề, hỗ trợ đào tạo,...
Trung tâm tiếp vận giữa đường sắt và đường bộ gắn với khu vực ga Phú Xuyên với tính chất quan trọng của khu vực, đóng vai trò lưu giữ, phân phối và trung chuyển giữa Hà Nội và vùng xung quanh, gồm các dịch vụ kho bãi, ngoại quan, kho chứa nguyên liệu xăng dầu ga…, sửa chữa, cung cấp phương tiện và dịch vụ vận chuyển, các dịch vụ tài chính, thương mại, ăn nghỉ...
Mục tiêu quy hoạch là nhằm xác định khung kết cấu hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội. Trong đó lưu ý kết nối hạ tầng giữa các khu phát triển mới và đô thị làng xóm hiện có. Phát triển khu trung tâm đào tạo, nhất là hệ thống các trung tâm đào tạo nghiên cứu công nghệ sinh học và công nghệ ứng dụng sản xuất nông nghiệp, chế biến sản phẩm nông nghiệp. Phát triển đô thị hiện đại gắn với bảo tồn tôn tạo các giá trị di sản truyền thống của địa phương. Đồng thời, hình thành các trung tâm tiếp vận hàng hóa và Logistics tại các khu vực đầu mối giao thông. Xây dựng mới gắn với việc cải tạo nâng cấp các khu vực hiện hữu, khớp nối đồng bộ về hạ tầng kiến trúc, kỹ thuật, nâng cao điều kiện môi trường sống, cảnh quan chung…