Cụ thể, trong lĩnh vực ngân sách nhà nước, KTNN sẽ tổ chức kiểm toán báo cáo quyết toán ngân sách năm 2016 tại Bộ Kế hoạch - Đầu tư, Bộ Tài chính, 13 bộ, cơ quan T.Ư và 47 tỉnh, thành trực thuộc T.Ư.
Trong năm 2017, KTNN sẽ kiểm toán hơn 20 dự án BOT.
Theo đó, trong lĩnh vực tài chính, ngân hàng, KTNN sẽ kiểm toán 34 đầu mối gồm: Ngân hàng Nhà nước; 25 tập đoàn, tổng công ty nhà nước; 8 ngân hàng và các tổ chức tài chính, tín dụng, trong đó có 2 ngân hàng được mua lại với giá 0 đồng. Kiểm toán Nhà nước sẽ tổ chức 27 cuộc kiểm toán chuyên đề trong năm 2017.
Đặc biệt, trong diện kiểm toán sẽ có 20 dự án BOT, 1 dự án BOT kết hợp BT, 1 dự án BT, trong đó có nhiều dự án đang gây tranh cãi với nhiều vấn đề khiến người dân bức xúc trong thời gian qua. KTNN cho biết sẽ tập trung để đánh giá việc thực hiện luật Đầu tư công, các chỉ thị của Thủ tướng, chú trọng kiểm toán các dự án giao thông đầu tư theo hình thức hợp đồng BOT; hiệu quả sử dụng vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA), vốn vay ưu đãi của các nhà tài trợ nước ngoài; các biện pháp xử lý nợ đọng và đẩy mạnh công tác quyết toán vốn đầu tư các dự án hoàn thành sử dụng vốn nhà nước.